2ª Divisão Juniores A Série E 2012/2013

Qualificam-se para a Fase de Subida 12 equipas: 2 de cada uma das cinco séries, 1 da Madeira e outra dos Açores. Serão divididas em 2 séries de 6 equipas, que jogarão entre si, a 2 voltas e iniciando com zero pontos. Sobem à 1ª Divisão as 3 primeiras equipas de cada uma das 2 séries.
As restantes 8 equipas jogam dentro da cada série entre si, a 2 voltas e com a totalidade dos pontos da 1ª fase. Descem aos Distritais as 3 últimas de cada série, mais os 3 piores quintos classificados.