O jovem lateral chegou ao Benfica a meio de 2016/17, com a perspetiva de chegar a curto/médio prazo à titularidade na equipa então orientada por Rui Vitória, mas as expectativas saíram goradas.
Pedro Pereira cumpriu apenas um jogo na equipa principal do Benfica e acabou cedido por um período de 18 meses ao Génova, clube que ficou com uma cláusula de opção de compra cifrada nos 4,5 milhões de euros.
Entretanto, o tempo de empréstimo terminou no final da temporada e ainda não há notícias sobre o futuro do lateral de 21 anos. É um dos casos pendentes na agenda encarnada.